细菌性阴道病可以通过性传播，但一直存在争议。因为加特纳菌是正常阴道菌群中的组成菌，患有细菌性阴道病患者存在着明显的菌群失调，是由于阴道菌群失调引起发病，还是由于患细菌性阴道病而引起菌群失调有待进一步研究。
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